Погода является одним из факторов, вызывающим наибольшие сложности в реальном полете. В игре Flight Simulator можно выбрать заранее установленные погодные условия (т.н. погодные темы), загрузить погодные данные из Интернета (функция Реальная погода) или задать свои собственные (функция Настройка погоды вручную).